Me es grato dirigirme a ustedes, desde la Secretaría de Posgrado de la Facultad de Ingeniería de la Universidad Nacional de Entre Ríos, a los fines de informarle sobre el dictado de un nuevo Curso de Posgrado, que comenzará a partir del 05 de abril de 2013, en la sede de nuestra Facultad, Oro Verde, Entre Ríos.
Modelado y simulación computacional avanzada de macromoléculas
Duración: 90 horas totales. Acreditable a la carrera de Maestría en Ingeniería Biomédica - FI-UNER
Docente/s a cargo: Dr. Darío ESTRIN / Dr. Marcelo MARTÍ
Concepto de simulación computacional en ciencia. Relación entre experimento, teoría y simulación. Simulación computacional en química. Métodos ab-initio. Ecuaciones de Hartree-Fock. Funciones de base. Determinación de propiedades moleculares. Métodos semiempíricos. Idea general e implementaciones CNDO, MNDO, INDO. Modelos semiempíricos basados en parametrización: métodos AM1 y PM3. Métodos de campos de fuerzas parametrizados. Campos de fuerzas para agua. Modelos de campo medio. Modelos polarizables. Termodinámica estadística. Conceptos básicos. Aplicación a técnicas de simulación. Cálculos de energía libre. Funciones termodinámicas energía y entropía. Dinámica de Proteínas. Estabilidad de la dinámica proteica y su caracterización. Métodos de predicción de complejos macromoleculares. Interacción proteína ligando, métodos de predicción y cálculo de afinidades. Contribuciones a la energía libre de unión. Modelos de multiescala y de Grano-Grueso. Teoría de frustración en proteínas, plegado, rugosidad del paisaje energético, interacciones nativas, paradoja de Levinthal, simulación de sistemas coarse-grain, combinación de MD y MC, réplica exchange. Métodos híbridos cuántico-clásicos. Modelado de fenómenos reactivos. Efectos del entorno. Modelos del continuo. Esquemas de Onsager y esquema PCM.
Fecha de Inicio: Viernes 05 de Abril de 2013
Saluda cordialmente.
--------------------
Facultad de Ingeniería
Universidad Nacional de Entre Ríos
Ruta 11 - Km. 10 - Oro Verde - Entre Ríos
Argentina
(054) 0343-4975100 (int. 134 ó 132)
posgrado@bioingenieria.edu.ar
